اوپن‌ای‌آی با استفاده از عامل‌های GPT-Rosalind، اطلس مغز موش را در ۳۲ دقیقه تحلیل کرد
اوپن‌ای‌آی با استفاده از عامل‌های GPT-Rosalind، اطلس مغز موش را در ۳۲ دقیقه تحلیل کرد
این اطلس حدود ۷٫۷ میلیون سلول و ۱٬۹۴۷ ژن مرتبط با بیماری را پوشش می‌دهد؛ ارتباط‌های زیستی پیشنهادی همچنان باید در آزمایشگاه بررسی شوند.
نویسنده: سایمون یون
تاریخ انتشار: ۲۱ اکتبر ۲۰۲۶، ساعت ۱۰:۰۶ شب به وقت منطقه شرقی آمریکا
اوپن‌ای‌آی، پرترب‌ای‌آی و مؤسسه پژوهشی اسکریپس با به‌کارگیری نزدیک به ۲ هزار عامل GPT-Rosalind، اطلس ژنی موجود از مغز موش را در مدت ۳۲ دقیقه تحلیل کردند. حاصل این کار، سرنخ‌هایی برای پژوهش‌های آزمایشگاهی بعدی است که هنوز باید انجام شوند.
این منبع داده بر پایه آزمایشی تهیه شده است که در آن، واکنش سلول‌های مغز موش پس از مختل کردن ۱٬۹۴۷ ژن مرتبط با بیماری اندازه‌گیری شد. مجموعه داده حاصل، اطلاعات حدود ۷٫۷ میلیون سلول را در بر می‌گیرد. روش «Perturb-seq» از ترکیب مختل‌سازی ژن‌ها با فناوری کریسپر (CRISPR) و توالی‌یابی آران‌ای در سطح تک‌هسته استفاده می‌کند؛ روشی که فعالیت ژن‌ها را درون هسته‌های منفرد سلول اندازه‌گیری می‌کند.
عامل‌های GPT-Rosalind واکنش‌های سلولی ثبت‌شده را بررسی کردند و برای یافتن توضیح‌های احتمالی، آن‌ها را با پژوهش‌های علمی منتشرشده تطبیق دادند. اندازه‌گیری‌های زیستی را پژوهشگران پیش‌تر انجام داده بودند و سامانه هوش مصنوعی نتایج به‌دست‌آمده را تحلیل کرد. خروجی این فرایند، ژن‌ها، اثرات مشاهده‌شده بر سلول‌ها و پژوهش‌های پیشین را در قالب اطلس قابل جست‌وجویی سازمان‌دهی می‌کند.
پژوهشگران برآورد می‌کنند که تحلیلگران انسانی برای بررسی داده‌های مشابه، در صورتی که هر بار یک ژن تغییریافته را بررسی کنند، به چند ماه تا یک سال زمان نیاز خواهند داشت. این رقم یک برآورد پیش‌بینی‌شده است، نه نتیجه آزمایشی زمان‌سنجی‌شده که در آن تحلیلگران انسانی همین کار را انجام داده باشند.
در بزرگ‌ترین مقایسه از نظر حجم کار، عامل‌های توزیع‌شده بیش از ۷۰۰ منبع را ارجاع دادند، در حالی که سامانه متکی بر یک عامل تنها به ۱۱ منبع استناد کرد. در ارزیابی‌های کور، کارشناسان در ۷۵ درصد موارد گزارش‌های عامل‌های توزیع‌شده را ترجیح دادند. این نتیجه صرفاً ترجیح ارزیابان میان گزارش‌ها را نشان می‌دهد و تأییدی بر درستی توضیح‌های زیستی پیشنهادی نیست.
یکی از سرنخ‌های پژوهشی به ژن DCTN1 مربوط می‌شود که با سندرم پری ارتباط دارد. در اطلس، مختل کردن این ژن با افزایش فعالیت ژن‌های دخیل در تولید کلسترول همراه بود. عامل‌های هوش مصنوعی انتقال کلسترول را به‌عنوان توضیحی احتمالی پیشنهاد کردند که دانشمندان می‌توانند آن را بررسی کنند. با این حال، این سازوکار همچنان یک فرضیه است و هدف دارویی تأییدشده‌ای به شمار نمی‌رود.
سارا تایشمن، استاد پزشکی سلول‌های بنیادی در دانشگاه کمبریج و یکی از بنیان‌گذاران و رؤسای مشترک طرح اطلس سلول‌های انسانی، گفت: «هوش مصنوعی می‌تواند به پژوهشگران بیشتری کمک کند تا این منابع را بررسی کنند و مشاهدات غیرمنتظره را به پرسش‌های تازه‌ای تبدیل کنند که باید در آزمایش‌ها مورد سنجش قرار گیرند.»
اوپن‌ای‌آی و پرترب‌ای‌آی قصد دارند از داده‌های درون‌تنی پرترب‌ای‌آی برای شناسایی مشترک اهداف دارویی استفاده کنند. این همکاری پس از آن مطرح شده است که اوپن‌ای‌آی روز سه‌شنبه، ۲۰ اکتبر، شرکت Orchestra Bio را خریداری کرد؛ شرکتی که نرم‌افزار هماهنگی برنامه‌های دارویی را به مجموعه ابزارهای علوم زیستی Rosalind این شرکت افزود. مطالعه مربوط به عامل‌های هوش مصنوعی هنوز به‌صورت پیش‌چاپ منتشر شده است و سازوکار پیشنهادی درباره ژن DCTN1 نیز همچنان به آزمایش تجربی نیاز دارد.