یادگیری ماشین ارتباطی میان پالمیتویلاسیون و سرطان کولورکتال با ریزمحیط سرد را آشکار می‌کند

bioengineer.org

انتشار در منبع: انتشار در سایت ما:

مقاله اصلی · English

تصویر تولیدشده با هوش مصنوعی
اعتبار تصویر: تولیدشده با هوش مصنوعی

یک مطالعه پیش‌بالینی گزارش می‌دهد که پالمیتویلاسیون پروتئین انگشت حلقه‌ای RNF14 با جلوگیری از تجزیه آن به‌واسطه یوبیکوئیتین، موجب پایداری این پروتئین می‌شود؛ فرایندی که سوخت‌وساز چربی را تقویت می‌کند و رشد تومور را در مدل‌های سرطان کولورکتال افزایش می‌دهد. پژوهشگران همچنین یک مسیر تنظیمی بالادستی را شناسایی کرده‌اند که در آن، استیل‌ترانسفراز GCN5 فاکتور رونویسی YY1 را تغییر می‌دهد و با افزایش بیان ZDHHC9، امکان پالمیتویلاسیون RNF14 را فراهم می‌کند. این پژوهش با استفاده از رده‌های سلولی سرطان کولورکتال و یک مدل پیوند زنوگرافت در موش انجام شده است؛ بنابراین، یافته‌های آن به مدل‌های آزمایشی مربوط می‌شود و بیانگر نتایج بالینی در افراد مبتلا به سرطان کولورکتال نیست.

پژوهشگران بر تغییر شیمیایی RNF14 در موقعیت سیستئین ۴۰۷ تمرکز کردند. آن‌ها با استفاده از انتقال ژن به‌واسطه آدنوویروس، سازه‌های حاوی RNF14 نوع طبیعی یا نوع فاقد قابلیت پالمیتویلاسیون را وارد سلول‌ها کردند تا اهمیت عملکردی این جایگاه را بررسی کنند. نتایج نشان می‌دهد که پالمیتویلاسیون موجب پایداری RNF14 می‌شود و نقش این پروتئین را در سوخت‌وساز چربی و رشد تومور تقویت می‌کند.

خاموش‌سازی ژن ZDHHC9 پالمیتویلاسیون RNF14 را مختل کرد، سوخت‌وساز چربی را کاهش داد و پیشرفت تومور را در مدل‌های بررسی‌شده به‌شدت مهار کرد. در مجموع، این مشاهدات از وجود رابطه‌ای علّی میان این تغییر مولکولی، پایداری RNF14 و ویژگی‌های مرتبط با رشد که در سامانه آزمایشی اندازه‌گیری شده‌اند، پشتیبانی می‌کنند. آزمایش‌های بررسی برهم‌کنش و تغییرات پروتئینی نیز نشان دادند که ZDHHC9، آنزیمی از خانواده پالمیتویلازهای دارای انگشت روی و نوع DHHC، پالمیتویلاسیون RNF14 را کاتالیز می‌کند.

سپس پژوهشگران منشأ افزایش بیان ZDHHC9 را به استیلاسیون YY1 به‌واسطه GCN5 مرتبط کردند. بر اساس نتایج، استیلاسیون YY1 بیان ZDHHC9 را فعال می‌کند و بدین‌ترتیب، یک محور تنظیمی چهارمرحله‌ای شکل می‌گیرد: GCN5 پروتئین YY1 را استیله می‌کند؛ YY1 فعال‌شده بیان ZDHHC9 را افزایش می‌دهد؛ ZDHHC9 پالمیتویلاسیون RNF14 را در موقعیت سیستئین ۴۰۷ تقویت می‌کند؛ و RNF14 پایدارشده به بازبرنامه‌ریزی سوخت‌وساز چربی و پیشرفت سرطان کولورکتال کمک می‌کند. پژوهشگران برای بررسی بیان پروتئین‌ها از وسترن بلات، برای مطالعه برهم‌کنش‌های پروتئین‌ـ‌پروتئین از ایمنوپرسیپیتاسیون و برای مشاهده ویژگی‌های مرتبط سلولی از ایمونوفلورسانس استفاده کردند.

تغییرات پساترجمۀ پروتئین‌ها نیز بررسی شد. میزان پالمیتویلاسیون RNF14 با روش گیراندازی مبتنی بر رزین آسیل اندازه‌گیری شد و زنده‌مانی سلول‌ها با آزمون کیت شمارش سلولی 8 (CCK-8) مورد ارزیابی قرار گرفت. این روش‌های مکمل به پژوهشگران کمک کردند تا ارتباط میان تغییر شیمیایی پروتئین و دگرگونی‌های پایداری RNF14، سوخت‌وساز چربی، زنده‌مانی سلولی و رفتار تومور را بررسی کنند.

نویسندگان یافته‌های خود را شواهدی از وجود سازوکاری وابسته به پالمیتویلاسیون برای تنظیم سوخت‌وساز چربی در سرطان کولورکتال توصیف کردند و محور GCN5–YY1–ZDHHC9–RNF14 را به‌عنوان هدف درمانی بالقوه پیشنهاد دادند. بااین‌حال، این پیشنهاد همچنان در مرحله پیش‌بالینی است. شواهد ارائه‌شده در این مطالعه شامل کارآزمایی بالینی انسانی، نتایج درمان بیماران، داده‌های مربوط به ایمنی درمان یا شواهدی مبنی بر سودمندی مهار هر یک از اجزای این مسیر برای افراد مبتلا به سرطان کولورکتال نیست.

این مقاله در ۲۲ اکتبر ۲۰۲۶ در مجله Cellular and Molecular Life Sciences منتشر شده است. مقاله به‌صورت دسترسی آزاد و با داوری همتا، پیش از انتشار نسخه نهایی رسمی، در دسترس قرار گرفته و ممکن است هنوز ویرایش‌های بیشتری روی آن انجام شود.

موضوع پژوهش: بررسی پیش‌بالینی مسیر GCN5–YY1–ZDHHC9–RNF14 در تنظیم سوخت‌وساز چربی و رشد تومور در مدل‌های سرطان کولورکتال.

عنوان مقاله: استیلاسیون YY1 به‌واسطه GCN5، پالمیتویلاسیون RNF14 وابسته به ZDHHC9 را افزایش می‌دهد و پیشرفت سرطان کولورکتال را تقویت می‌کند.

مشخصات مقاله: Li, B.-F., Li, G.-Q., Lv, F.-Y., Li, Q.-H., & Lv, L. (2026). GCN5-mediated acetylation of YY1 enhances ZDHHC9-dependent palmitoylation of RNF14 and promotes colorectal cancer progression. Cellular and Molecular Life Sciences. https://doi.org/10.1007/s00018-026-06493-7

شناسه دیجیتال مقاله (DOI): 10.1007/s00018-026-06493-7

کلیدواژه‌ها: سرطان کولورکتال، پالمیتویلاسیون RNF14، GCN5، استیلاسیون YY1، ZDHHC9، سوخت‌وساز چربی، رده‌های سلولی سرطانی، زنوگرافت موشی، استیلاسیون با واسطه GCN5، افزایش وابسته به ZDHHC9.